MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 42515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009443	AAC	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146322039
2	NC_009443	T	6	6	17	22	0 %	100 %	0 %	0 %	146322039
3	NC_009443	A	6	6	148	153	100 %	0 %	0 %	0 %	146322039
4	NC_009443	A	7	7	164	170	100 %	0 %	0 %	0 %	146322039
5	NC_009443	TAC	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146322039
6	NC_009443	AAG	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146322039
7	NC_009443	CTC	2	6	323	328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146322039
8	NC_009443	AAT	2	6	400	405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146322039
9	NC_009443	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146322039
10	NC_009443	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146322039
11	NC_009443	TCA	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146322039
12	NC_009443	A	7	7	631	637	100 %	0 %	0 %	0 %	146322039
13	NC_009443	ACTT	2	8	653	660	25 %	50 %	0 %	25 %	146322039
14	NC_009443	TGA	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146322039
15	NC_009443	TC	3	6	679	684	0 %	50 %	0 %	50 %	146322039
16	NC_009443	TAA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146322039
17	NC_009443	CAA	2	6	695	700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146322039
18	NC_009443	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146322039
19	NC_009443	A	7	7	740	746	100 %	0 %	0 %	0 %	146322039
20	NC_009443	GAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146322039
21	NC_009443	CTATC	2	10	928	937	20 %	40 %	0 %	40 %	146322039
22	NC_009443	ACGT	2	8	959	966	25 %	25 %	25 %	25 %	146322039
23	NC_009443	TGC	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146322039
24	NC_009443	ACAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	0 %	25 %	146322039
25	NC_009443	CG	3	6	1188	1193	0 %	0 %	50 %	50 %	146322039
26	NC_009443	GACA	2	8	1224	1231	50 %	0 %	25 %	25 %	146322039
27	NC_009443	ATGC	2	8	1285	1292	25 %	25 %	25 %	25 %	146322039
28	NC_009443	AATAA	2	10	1297	1306	80 %	20 %	0 %	0 %	146322039
29	NC_009443	CTC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146322039
30	NC_009443	GAT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146322039
31	NC_009443	A	6	6	1356	1361	100 %	0 %	0 %	0 %	146322039
32	NC_009443	T	6	6	1387	1392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009443	A	6	6	1393	1398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009443	T	6	6	1404	1409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009443	TCA	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009443	ACT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009443	ATA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009443	TAA	2	6	1545	1550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319851
39	NC_009443	AT	3	6	1553	1558	50 %	50 %	0 %	0 %	146319851
40	NC_009443	A	6	6	1599	1604	100 %	0 %	0 %	0 %	146319851
41	NC_009443	TTA	2	6	1772	1777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319851
42	NC_009443	AAG	2	6	1880	1885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319851
43	NC_009443	ACAA	2	8	1956	1963	75 %	0 %	0 %	25 %	146319851
44	NC_009443	GTC	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319851
45	NC_009443	TGA	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319851
46	NC_009443	TGT	2	6	2127	2132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319851
47	NC_009443	TC	3	6	2146	2151	0 %	50 %	0 %	50 %	146319851
48	NC_009443	GAT	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319851
49	NC_009443	TCT	2	6	2198	2203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319851
50	NC_009443	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319851
51	NC_009443	TTA	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319851
52	NC_009443	TACC	2	8	2268	2275	25 %	25 %	0 %	50 %	146319851
53	NC_009443	ACCG	2	8	2281	2288	25 %	0 %	25 %	50 %	146319851
54	NC_009443	GTACA	2	10	2390	2399	40 %	20 %	20 %	20 %	146319851
55	NC_009443	TAA	2	6	2412	2417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319851
56	NC_009443	TGT	2	6	2418	2423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319851
57	NC_009443	ACTT	2	8	2520	2527	25 %	50 %	0 %	25 %	146319852
58	NC_009443	TCT	2	6	2580	2585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319852
59	NC_009443	GTCC	2	8	2586	2593	0 %	25 %	25 %	50 %	146319852
60	NC_009443	AAT	2	6	2610	2615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319852
61	NC_009443	ATA	2	6	2664	2669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009443	A	6	6	2707	2712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009443	TA	3	6	2731	2736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009443	TA	4	8	2762	2769	50 %	50 %	0 %	0 %	146319853
65	NC_009443	CTG	2	6	2798	2803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319853
66	NC_009443	CATAT	2	10	2806	2815	40 %	40 %	0 %	20 %	146319853
67	NC_009443	AAAG	2	8	2824	2831	75 %	0 %	25 %	0 %	146319853
68	NC_009443	A	6	6	2882	2887	100 %	0 %	0 %	0 %	146319853
69	NC_009443	AGT	2	6	2920	2925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319853
70	NC_009443	TTA	2	6	3006	3011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319853
71	NC_009443	TA	3	6	3062	3067	50 %	50 %	0 %	0 %	146319853
72	NC_009443	AG	3	6	3087	3092	50 %	0 %	50 %	0 %	146319853
73	NC_009443	AT	3	6	3106	3111	50 %	50 %	0 %	0 %	146319853
74	NC_009443	A	7	7	3202	3208	100 %	0 %	0 %	0 %	146319853
75	NC_009443	ATT	2	6	3264	3269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319853
76	NC_009443	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319853
77	NC_009443	T	6	6	3334	3339	0 %	100 %	0 %	0 %	146319853
78	NC_009443	TGG	2	6	3366	3371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319853
79	NC_009443	GAAG	2	8	3408	3415	50 %	0 %	50 %	0 %	146319853
80	NC_009443	TTA	2	6	3475	3480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319853
81	NC_009443	TCT	2	6	3496	3501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319853
82	NC_009443	ATT	3	9	3555	3563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319853
83	NC_009443	GA	3	6	3575	3580	50 %	0 %	50 %	0 %	146319853
84	NC_009443	GTAT	2	8	3623	3630	25 %	50 %	25 %	0 %	146319853
85	NC_009443	AGG	2	6	3636	3641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319853
86	NC_009443	TCA	2	6	3695	3700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319854
87	NC_009443	TAA	2	6	3720	3725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319854
88	NC_009443	ATG	2	6	3790	3795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319854
89	NC_009443	ACT	2	6	3863	3868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009443	A	6	6	3932	3937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009443	GAG	2	6	3938	3943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009443	TGG	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319855
93	NC_009443	AAC	2	6	4176	4181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319855
94	NC_009443	AATG	2	8	4189	4196	50 %	25 %	25 %	0 %	146319855
95	NC_009443	GAA	2	6	4214	4219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319855
96	NC_009443	TGT	2	6	4246	4251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319855
97	NC_009443	ATT	2	6	4288	4293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319855
98	NC_009443	ATT	2	6	4302	4307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319855
99	NC_009443	A	8	8	4389	4396	100 %	0 %	0 %	0 %	146319856
100	NC_009443	CAG	2	6	4408	4413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319856
101	NC_009443	TCG	2	6	4417	4422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319856
102	NC_009443	TCA	2	6	4567	4572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319856
103	NC_009443	AAAT	2	8	4658	4665	75 %	25 %	0 %	0 %	146319856
104	NC_009443	AG	3	6	4820	4825	50 %	0 %	50 %	0 %	146319856
105	NC_009443	CAA	2	6	4829	4834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319856
106	NC_009443	A	6	6	4852	4857	100 %	0 %	0 %	0 %	146319856
107	NC_009443	A	6	6	4909	4914	100 %	0 %	0 %	0 %	146319856
108	NC_009443	AGA	2	6	4928	4933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319856
109	NC_009443	GAA	2	6	4968	4973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319856
110	NC_009443	A	6	6	4975	4980	100 %	0 %	0 %	0 %	146319856
111	NC_009443	TGA	2	6	5036	5041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319856
112	NC_009443	GCA	2	6	5097	5102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319856
113	NC_009443	GTG	3	9	5118	5126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319856
114	NC_009443	CGA	2	6	5162	5167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319856
115	NC_009443	CTTG	2	8	5245	5252	0 %	50 %	25 %	25 %	146319856
116	NC_009443	CAG	2	6	5271	5276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319857
117	NC_009443	AGG	2	6	5283	5288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319857
118	NC_009443	CTC	2	6	5322	5327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319857
119	NC_009443	GAT	2	6	5393	5398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319857
120	NC_009443	AAG	2	6	5430	5435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319857
121	NC_009443	GAA	2	6	5450	5455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319857
122	NC_009443	CAT	2	6	5485	5490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319857
123	NC_009443	TTC	2	6	5530	5535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_009443	GTT	2	6	5536	5541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009443	GAT	2	6	5615	5620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009443	TTGG	2	8	5624	5631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009443	A	6	6	5665	5670	100 %	0 %	0 %	0 %	146319858
128	NC_009443	GATT	2	8	5677	5684	25 %	50 %	25 %	0 %	146319858
129	NC_009443	AAACA	2	10	5719	5728	80 %	0 %	0 %	20 %	146319858
130	NC_009443	TGC	2	6	5743	5748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319858
131	NC_009443	A	6	6	5836	5841	100 %	0 %	0 %	0 %	146319858
132	NC_009443	ATGA	2	8	5868	5875	50 %	25 %	25 %	0 %	146319858
133	NC_009443	TTA	2	6	5906	5911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319858
134	NC_009443	TAG	2	6	5935	5940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319858
135	NC_009443	GAC	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319858
136	NC_009443	TGG	2	6	5999	6004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319858
137	NC_009443	TGTCT	2	10	6110	6119	0 %	60 %	20 %	20 %	146319858
138	NC_009443	GAA	2	6	6195	6200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319858
139	NC_009443	GAT	2	6	6201	6206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319858
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272	NC_009443	GGCG	2	8	12213	12220	0 %	0 %	75 %	25 %	146319865
273	NC_009443	GCA	2	6	12337	12342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319865
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275	NC_009443	AAT	2	6	12453	12458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319865
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385	NC_009443	A	6	6	16773	16778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
386	NC_009443	AGA	2	6	16860	16865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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394	NC_009443	AGA	2	6	17431	17436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
395	NC_009443	CAG	2	6	17493	17498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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397	NC_009443	AT	3	6	17677	17682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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399	NC_009443	CT	3	6	17708	17713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
400	NC_009443	GAA	2	6	17947	17952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
401	NC_009443	GGT	2	6	18021	18026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
402	NC_009443	GTC	2	6	18035	18040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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404	NC_009443	CAT	2	6	18103	18108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
405	NC_009443	TAA	2	6	18138	18143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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